personnages principaux
Otoha est le nom donnée à l'homme choisi pour devenir le Karas de Shinjuku. C'est le personnage principal de cette histoire. Il est le fruit d'une union incestueuse entre un chef des Yakuza qui contrôle Shinjuku et sa propre mère. Otoha est une machine à tuer qui est née sans la capaciité de ressentir la douleur physique ou la peur. De par sa constitution différente, son discernement froid et réaliste, sans aucune trace de sentiment, il est tenu à l'écart par son père, le chef de l'organisation, qui le craint et finit par l'attaquer. Avec Reiji, qu'il considère comme son petit frère, il se fait pourchasser par l'organisation avant de se faire blesser très grièvement. Il échoue finalement aux urgences dans un état critique. Yurine, qui a le pouvoir de contrôler les esprits des morts le choisit et enferme son âme dans l'armure de Karas pour en faire un serviteur de la ville.
Ekou Hôshunin a vécu sa vie humaine durant la révolution de Meiji, quand Edo est devenue Tokyo. C'est le fils d'un grand marchand destiné à reprendre l'affaire familiale. Le destin l'embarque dans la tourmente de la révolution, tandis qu'il laisse son frère cadet gérer la boutique. Ekou tombe gravement malade durant sa campagne, mais son engagement envers la ville lui permet de se faire remarquer par Yurine. Même après être devenu un Karas, Ekou garde le contact avec son frère et quand celui-ci disparaît, il fait construire un temple à sa mémoire, le "Hôshunin" (le temple du Phénix du Printemps). Il donne également ce nom au Zaibatsu qu'il crée. Il se repose sur la force de la famille de son défunt frère et participe très activement à la reconstruction de la ville après la guerre. Durant l'ère de Shôwa (1926-1989), il crée une tour géante et complexe : la Tour de la Providence (ou Ekou Tower). Actuellement, comme les vieillards de Kamakura en leur temps, il domine le monde des affaires dans l'ombre. Ceux qui dirigent son Zaibatsu de nos jours sont tous des descendants de son frère.
Tokyo a vécu très longtemps, voir plus qu'il ne fallait. Sa longévité a été rallongée à l'extrême par le système des pierres angulaires, c'est à dire les Mikura. Mais la ville elle-même ne veut pas reconnaître son dysfonctionnement. Elle fait naître une nouvelle Yurine. Pour mettre fin à cette résistance, le seul choix qui s'offre à Ekou est de fusionner toutes les pierres des Mikura, chacune responsable d'un élément, et en une seule et même machine géante. Il va même plus loin en décidant de remplacer la volonté de la ville et veut par la suite conquérir le monde.
Homura est une jeune fille qui a été choisie pour être le karas d'une autre ville. Intriquée par le conflit qui a éclaté à Shinjuku, elle monte à la capitale. Elle n'aurait pas dû, mais son naturel qui la pousse à vouloir toujours gagner la fait s'impliquer dans ces évènements.
Yurine est la représentante de la "volonté de la ville". C'est une prêtresse qui a l'aspect d'un esprit félin. Elle a comme un serviteur un Karas, dont elle contrôle l'activation de l'armure et la libération des pouvoirs associés. leurs vies étant liées, elle est le point faible du Karas.
Elle chasse ceux qui ne respectent pas la ville.
Minoru Sagisaka travaille au commissariat central de Shinjuku. Dans le passé, c'est un inspecteur hors pair. Sa fille unique, qu'il adore plus que tout, est cloîtrée dans un hôpital depuis qu'elle prétend avoir vu des yôkai. Il veut croire que sa fille dit la vérité, c'est pourquoi il enquête sans relâche sur les phénomènes paranormaux.
Narumi Kure est un jeune agent qui vient d'être affecté au commissariat central de Shinjuku. C'est un homme réaliste qui ne croit pas du tout aux phénomènes paranormaux. C'est un carriériste. La véritable raison de son affectation à ce poste est qu'il doit espionner ce qui s'y fait pour le compte du maire. Les objectifs confiés à Kure sont de tenir à l'Ïil le chef de la police, au comportement suspect, et de surveiller les activités de la brigade des enquêtes spéciales. Après bien des péripéties, il en arrive à reconnaître l'existences des yôkai, mais ne parvenant pas à mettre de l'ordre dans ses sentiments, il quitte Shinjuku avec Yoshiko, la fille de Sagisaka.
Les Nué sont des créatures fantastiques qui naissent toujours par paire. Ce sont des animaux qui peuvent contrôler la foudre. Ils ont pour particularité de parler comme des rônins de la période d'Edo en utilisant leur vocabulaire à tort et à travers, comme s'ils avaient mal appris à parler et retenu seulement des erreurs. Les Nué sont nés à l'ouest du pays et ont rencontré Ekou alors qu'ils commettaient quelques exactions dans la vieille ville d'Edo. Il les recueille et c'est lui qui leur donnera ce nom. Les Nué ont cru en lui, cru qu'il fallait sauver les yôkai victimes des humains qui vivent en ville. Pensant que cela pourrait être un moyen de ranimer cet endroit, les deux frères ont laissé Ekou modifier leurs corps pour les transformer en Mikura.
Pourtant, le plus vieux des deux jumeaux a ressenti un doute quant à la manière de procéder de l'ancien Karas. C'est pourquoi il se sépare de son frère et part pour un pèlerinage à travers tout le pays. Il se promène dans toutes les villes du japon et entre en contact avec les humains. Il retire de cette expérience une seule réponse : il faut qu'il arrache son frère des griffes des Ekou.
Amefurikozô est l'esprit d'un petit garçon jouant sous la pluie. Ce Yökai, ayant l'apparence d'un escargot portant un imperméable jaune, suit et aide Nué qu'il considère comme son grand-frère.
Les personnages secondaires
Wanyûdö est dans la mythologie japonaise une roue enflammée avec un visage au centre qui aspire l'âme de ceux qu'elle croise. Wanyûdö a été transformé en mikura, depuis il sillonne les routes le soir sous la forme d'une voiture de sport rouge avec lesrouesenflammées. Il s'en prend souvent aux voitures qui roulent à toute vitesse sur l'autoroute.
Suiko est un Kappa, c'est à dire un diablotin des eaux. Il vit dans le monde des humains en tant que catcheur professionnel. Transformé en mikura, il hante les toilettes publiques et aspire l'essence vitale de ses visiteurs ne laissant à chaque fois qu'un seul survivant
Tsuchigumo est une yôkai qui prend la forme d'une araignée géante. Elle peut attaquer en tissant une toile d'araignée, mais elle peut également libérer des petites araignées logées à l'intérieur de son corp qui lui obéissent au doigt et à l'oeil. Elle seconde Ekou dans ses recherches.
A la base, Kamaitachi est un Yökai qui découpe en tranches ceux qui sont aspirés à l'intérieur des tornades. Il est le premier Yökai à avoir été transformé en mikura, c'est pourquoi son corps n'est pas très au point. Il possède deux épaisseurs de lames fixées sur le cou ainsi que des faucilles sur les avant-bras qui donnent la mort à coup sûr. Sous sa forme de mikura, il est particulièrement adapté aux déplacements à grande vitesse. Sa tête et sa queue forment des poignards mortels. Il ressemble alors à un animal proche de la belette.
Ushi-Oni est un Yökai qui possède un corps de démon et une tête de boeuf. On raconte qu'il possède des capacités surnaturelles et une finesse d'esprit rare. Il arrive à se faire passer pour un humain sans problèmes. Tous les gens le craignent car c'est un mangeur d'hommes. Dans le monde des humains, il vit en tant que chef de la police.
Hinaru est une jeune fille qui enchaîne les "petits boulots". Alors qu'elle fait un reportage sur l'existence de Kappa dans les toilettes de la gare, elle et son équipe sont attaqués par le mikura Suiko. Elle est la seule survivante.
Yoshiko Sagisaka est une jeune fille qui, à la base, possède une constitution très sensible liée à la capacité de voir les esprits et les yôkai. Elle est la seule survivante d'une affaire de suicide collectif, en fait un massacre perpétré par un yôkai. La réaction de sa mère quand Yoshiko a affirmé avoir vu un tel monstre a été terrible : elle l'a enfermée dans un hôpital psychiatrique sans aucune concessionL Cela a causé un tel choc que son mari a fini par divorcer. A présent sous l'emprise de puissants tranquillisants et autres drogues, la personnalité de la jeune fille est complètement ravagée.